Programari

L'iPod pot reproduir arxius MP3, WAV, AAC/M4A, AIFF i Apple Lossless. L’ipod de 5 ª Generació també es capaç de reproduir arxius de vídeo en format H.264 i MPEG-04/10.
Apple va dissenyar l'iPod per a funcionar principalment en combinació amb el seu programa iTunes. Amb iTunes, es pot automàticament sincronitzar la música de la biblioteca de l'usuari amb la de l'iPod cada vegada que es connecta a l'ordinador. Les cançons, fotos i llistes de reproducció noves es copien automàticament a l'iPod i les cançons esborrades són eliminades també de l'iPod. Això funciona també en sentit invers, si es valora una cançó en l'iPod, la qualificació es copiarà a la biblioteca d'iTunes. A més si s'escolten audiollibres, la posició d'aquests també es sincronitzarà automàticament. iTunes dóna l'opció de sincronització manual a més de funció de sincronització automàtica. L'iPod de 5 ª Generació, l’Ipod Classic i l'última generació de reproductors iPod té la capacitat de descarregar jocs de diversa temàtica des del iTunes Store.